中西医助理医师的注册条件和主管部门如下：

（一）注册条件

凡取得中医医师资格的，均可以申请中医医师执业注册。未经注册取得执业证书的，不能从事医疗活动。

（二）主管部门

卫生部负责全国医师执业注册监督管理工作。县级以上地方卫生、中医药行政管理部门是中医医师执业注册的主管部门，负责本行政区域内的医师执业注册监督管理工作。