"指示"同"命令（令）"相比，都是领导机关发出的具有强制性、规定性和约束力的指挥性公文，下级机关必须贯彻执行。不同的地方主要是：
　　（1）发布的权限机关不同。命令（令）的发布权限机关，级别一般比较高，所限范围较窄。通常只能由《中华人民共和国宪法》中规定的国家行政领导机关、部门及其领导人发布；而发布指示的机关范围较宽，任何上级党政领导机关都可以对所属的下级机关布置工作，发布"指示"。
　　（2）强制程度不同。命令（令）的严肃性、强制性和不可逆转性，要求受文机关必须无条件地、坚决地执行，没有任何商量的余地；而指示的执行过程，则可根据实际情况有所灵活变通。
　　（3）行文语气不同。命令（令）的行文，态度严肃郑重，文字简洁明快，语气肯定有力；而指示的行文，则重在分析说理，篇幅相对较长，语气缓和平稳。